萌玄道以“大曰生，生曰久，久曰回；大曰逝，逝曰远，远曰返；大曰和，和曰怡，怡曰真”，作为思想核心和总纲，也即“生久回、逝远返、和怡真”是萌玄道的九字核心。此思想核心和总纲也可以用“为天地健心，为生民康命；继智哲新道器，续圣贤生绝学；承万届开盛平，延人类拓宏宇（改编自 张载 名言）”作为类似诠释。
萌玄道的核心、主干思想还可以用“自然·玄玄，生生·和怡，科学·三三”等六个骨干词汇补充概括。
自然就是自然而然，这继承了道家崇尚“道法自然”及“自然而然”的一贯传统。
玄玄则内含无无、有有、屯屯三个分支，三个分支也是进入众妙的三大门户（方法）。
生生就是天道生生和生生不息，创生和生生思想也居于萌玄道思想核心之首。
和怡就是动态平衡、和谐、怡悦。
科学就是现代科学，提倡：提升科学素养、努力掌握科学知识、科学思想、科学方法和科学精神。
三三就是三分三重的简写，也即萌玄道以三分图式（萌-太玄方法论/三分法思维模式）为中间重（中轴/主体），以三重图式包含“中间重”并补充“两翼（左翼重和右翼重）”，从而取得兼容全面的方法论（思维模式），它具体包括：
左翼重：系统-整体方法（一分法主导）、易-太极方法（二分法主导）；
中间重：萌-太玄方法（一分为三论/三分法主导）；
右翼重：类笛卡尔方法（笛卡尔方法论/多分法主导）。
观察、阐述、思考和解决一个问题，可以采用多种视角、基本原则和一般方法，其不同之处就是突出了什么、忽略了什么的不同，正所谓“横看成岭侧成峰，远近高低各不同，不识庐山真面目，只缘身在此山中”。宋代苏轼此首《题西林壁》诗很有哲理，理解上：庐山可替换为世界或全体，此山可替换为一山或部分。
中国传统文化中蕴含的方法论（思维模式）也可以归纳为中轴加两翼结构，中轴（双核心）为“易-太极方法（一分为二/二分法）+萌-太玄方法（一分为三/三分法）”，左翼为系统-整体方法（一分为一/一分法），右翼为类笛卡尔方法（一分为多/多分法），图示如下：
中国传统文化蕴含的方法论（思维模式）中轴（双核心）还可以更详细地图示如下：
（易式两色）围棋可以作为太极方法论（太极思维模式）的演练器和象征物。
萌式三色围棋可以作为太玄方法论（太玄思维模式）的演练器和象征物。
易有太极，是生两仪，两仪生四象，四象生八卦，八卦定吉凶，吉凶生大业。
萌又太玄，是生三仪，三仪生九数，九数生二十七算，推算定吉凶，选择定成败。
“推算（八卦）”就是人类棋手或计算机程序棋手推演棋局和评估局势优劣吉凶的形式和过程，而棋局中每一步落子点的“决策选择”，将最终决定棋手本局棋的胜负。棋手“推算（八卦）”和“决策选择”能力的高低优劣，代表着棋手的棋力水平，围棋界一般以棋手的级段位和等级分表示。人生如棋，善算果决者多胜。
太极方法论（太极思维模式）和太玄方法论（太玄思维模式）及（易式两色）围棋思维方法和萌式三色围棋思维方法，也可以移植、运用于其它领域，以便充分发掘和体现它们的价值。
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