飞石三色围棋是飞弹三色围棋和钝石三色围棋的一种简化版，或者说是飞刀围棋的另一种变化版。
飞石三色围棋（Flystone three color Go）可以简称为飞石围棋（FlystoneGo/S3Go）。
飞石三色围棋规则与飞弹三色围棋和钝石三色围棋规则都大部分相同。飞石三色围棋是与钝石三色围棋搭配的一种趣味下法，类似飞刀围棋和围棋的关系。
飞石三色围棋的棋子分黑子、白子、灰子三种。为了更好的视觉效果，可以将灰子替换为花子。花子的花斑通常为“灰底斑马纹”或者“来氏太极图（中间填充灰色/加灰星）”。
飞石三色围棋基本下法同围棋，但是棋手在“飞石回合”可以连下两手，第一手下黑子或白子，第二手下花子，连下的第二手“花子”俗称为“飞石”。飞石三色围棋花子没有钝石三色围棋花子的“条件变黑白功能”，飞石三色围棋花子其它功能属性则与钝石三色围棋花子完全相同。
飞石三色围棋中的飞石可以在任意回合下出，但下飞石前要先声明，也即在本回合下出黑子或白子前，要预先告知对方，然后才可以下出1黑子、1飞石，或者下出1白子、1飞石。
飞刀围棋中，落在棋盘上的飞刀分黑子和白子，可以提吃对方棋串。
飞石三色围棋中，落在棋盘上的飞石为中性，不分黑白，飞石还有“提吃点禁手、彼方一气眼禁手和彼方虎口禁手（同飞弹三色围棋）”。而且飞石三色围棋中的花棋串只具有不会发生变化的一种底层属性——中性分隔串属性（类同棋盘边界外区域），黑棋主角和白棋主角“争地决胜”，无法争花。
飞弹三色围棋中，落在棋盘上的飞弹形成的花棋串不仅具有不会发生变化的一种底层属性——中性分隔串属性，还具有会发生变化的三种上层属性——中性分隔串属性、黑棋串属性和白棋串属性，黑棋主角和白棋主角“争地争花决胜”。而且飞弹也有“提吃点禁手、彼方一气眼禁手和彼方虎口禁手”。
飞石三色围棋（N）中的N值通常设定为3，且N值为3是默认值，可省略。这种情况下，黑方和白方各拥有3个飞石，总计6个飞石。
飞石三色围棋通常采用9路、11路或13路等小棋盘，每方3个飞弹，并有三种对弈模式：
A模式：每方3个飞石，1个随机飞石+2个自主飞石，其中1个飞石扔出时机（手数）由程序随机确定，其中2个飞石扔出时机（手数）由棋手自主决定。
B模式：每方3个飞石，全是随机飞石，飞石扔出时机（手数）全由程序随机确定。
C模式：每方3个飞石，全是自主飞石，飞石扔出时机（手数）全由棋手自主决定。
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